Výskum transportu sedimentov – vykonávame na základe priamych meraní transportu splavenín a plavenín a s využitím najnovších teoretických poznatkov a numerických a fyzikálnych modelov. Hodnotíme časovú a priestorovú variabilitu transportu sedimentov, kvantifikujeme odtok sedimentov a identifikujeme príčiny režimových zmien. Prognózy vývoja riečneho dna vykonávame s využitím numerických modelov (1D, 2D). Pre oblasti vodných diel navrhujeme ochranné opatrenia na obmedzenie zanášania v oblasti vzdutia a zmiernenie erózie dna pod vodnými dielmi. Pre oblasti s narušenou bilanciou sedimentov pripravujeme zásady manažmentu sedimentov vrátane návrhu systematického monitorovania režimu sedimentov.
Ako jediné pracovisko na Slovensku sa dlhodobo zaoberáme kvantitatívnou morfológiou tokov a nádrží. Výsledky výskumu morfológie riek a nádrží z minulosti umožňujú hodnotenie ich súčasného stavu i vývoja. Historické mapy, archívne materiály a (nástroje GIS) využívame k analýzam dlhodobého morfologického vývoja riek a záplavových území a k identifikovaniu zmien vrátane určenia príčin týchto zmien. Pre definované tlaky navrhujeme účinné a dlhodobo udržateľné ochranné/ revitalizačné opatrenia. Zamerania topografie vodných nádrží SR sú podkladom pre určenie intenzity zanášania, aktualizáciu čiar objemov a návrh ochranných opatrení v nádrži i povodí. Pre hodnotenie morfológického vývoja tokov a vodných nádrží vydávame záväzné metodické usmernenia a poskytujeme odborné konzultácie.
Revitalizácia riečnych systémov sa sústreďuje na výskum spolupôsobenia riečnych procesov (transport sedimentov a prietokový režim), morfológie tokov a existujúcich tlakov. Overujeme možnosti vytvárania podmienok pre obnovu riečnych habitátov, ktoré sú blízke pôvodnej morfologickej typológii. S využitím vedeckých poznatkov a výsledkov výskumu pripravujeme komplexné štúdie revitalizácie riečnych systémov zamerané na obnovu fyzikálnych procesov narušených antropogénnou činnosťou. Analyzujeme príčiny a dôsledky zmien týchto procesov vo vzťahu k základným morfologickým parametrom korýt tokov a záplavových území. Pre identifikované deficity navrhujeme komplexné prírode blízke opatrenia, ktoré umožňujú čiastočnú alebo úplnú obnovu prirodzeného charakteru riek s ohľadom na obmedzenia dané najmä vodohospodárskym využívaním.
Návrhy revitalizačných opatrení sa orientujú na zlepšenie morfológie koryta a inundácie, obnovu hydrológie – posilnenie prirodzeného prietokového režimu, pozdĺžnej kontinuity transportu sedimentov, zlepšenie laterálnej konektivity: umožnenie bočného vývoja, prepojenie oddelených ramien, meandrov a mokradí. Vykonávame pred a po realizačný hydromorfologický monitoring, v rámci ktorého posudzujeme účinnosť opatrení a v prípade potreby navrhujeme ich modifikáciu. V súlade s príslušnou európskou legislatívou je našou ambíciou prostredníctvom komplexných revitalizačných štúdií a projektov prispieť k dosahovaniu vysokého stupňa obnovy a sprírodnenia upravených tokov Slovanska.